Klub Jerman Hamburg telah menetapkan Michael Oenning sebagai manajer tim Hamburg yang akan menggantikan Armin Veh. Manajer Hamburg sebelumnya, Armin Veh dipecat oleh Klub Hamburg setelah Hamburg harus menerima kekalahan yang memalukan dari Bayern Munich dengan skor 6 – 0. Setelah bertahan cukup lama, Hamburg memutuskan untuk mengangkat asisten pelatih Hamburg, Michael Oenning untuk menjalankan tugas manajer sampai dengan tahun 2012.
Kontrak tersebut telah berlaku untuk oenning dengan masa selama dua tahun dan mengenai kesepakatan lainnya sedang dibicarakan oleh klub Hamburg dengan Oenning. Oenning sendiri memiliki pengalaman menjadi seorang manajer ketika berada di FC Nuremberg. Selain itu, Oenning sebelumnya juga merupakan seorang pemain sepak bola profesional, namun karirnya sebagai pemain sepakbola kurang berhasil.
Di Nuremberg, Oenning bekerja sama dengan Von Heesen sampai dengan tahun 2008 ketika Von Heesen dipecat dan Oenning menggantikan dirinya. Ini merupakan pengalaman pertama bagi Oenning sebagai kepala pelatih. Setelah awal yang cukup lambat pada pertandingan Bundesliga, Oenning mampu membawa Nuremberg sampai pada posisi ketiga. Nuremberg memenangkan pertandinngan dengan skor 5 – 0 dan memulai debutnya di Bundesliga sejak tahun 2009.
Pada tahun 2009, Oenning dipecat oleh Nuremberg dan kemudian menjadi asisten pelatih dari Armin Veh. Sebelum Armin Veh dipecat oleh Hamburg, Oenning menjadi kepala pelatih dan menandatangani kontrak selama dua tahun sampai dengan bulan Juni 2013. Setelah awal yang buruk sebagai kepala pelatih Bundesliga yang membawa Hamburger pada posisi terakhir dengan hanya 1 poin. Oenning ditunjuk sebagai pelatih Hamburg SV.